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CONFLEX

張貼者:2010年9月19日 上午7:10未知的使用者   [ eddie liu 已於 2011年5月10日 下午8:33 更新 ]
CONFLEX可快速,準確,自動化的構象搜索和分析關鍵的藥物發現和化學工程。 是它獨有的CONFLEX搜索能力,完全靈活的空間構象分子找到每一個重大的最優結構的化學構象。CONFLEX不限於只在當地尋找優化結構,依賴於初始結構由用戶輸入。 


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開發商:Conflex Corporation
原廠網址:http://www.conflex.us/products.asp
更新日期:2011/05/11
採購正式版、大量授權報價、技術支援、軟體諮詢、委託採購、詢問報價請來電 02-29299388 分機16 , 
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新功能CONFLEX v.6.0   

  • 水晶包裝的構象
  • 氨基酸殘基替換
  • 溶劑效應 
    CONFLEX現在可以計算能源使用廣義出生溶劑型(國標 / SA)的。
  • 力場選項
    • 準互動 
      用戶可以添加準交互效果的力場。 用戶還可以包含其他的限制到指定的結構信息。
    • 點電荷 
      用戶可以定義每個原子點電荷。高斯的用戶,可以申請的部分費用計算高斯,並估計靜電相互作用。
  • 結構優化的選擇
    • 之間切換快速精確的結構優化
    • 收斂性和迭代
      用戶可以指定的趨同標準,並為每個迭代計算優化方法。
  • 構象搜索選項 
    CONFLEX承認的R / S配置的手性原子和E / Z的雙鍵。用戶現在可以添加你自己的絕對構型的原子。
  • 肽鍵選項
    CONFLEX認識到債券和可旋轉的逐步增加這些輪換名單。 用戶可以排除肽鍵(聯合新罕布什爾州),披- psi的債券(酰胺-鈣酰胺)或側鏈債券逐步從一輪換名單。
  • 普通模式動力學分析 
    通過結合多種振動模式,CONFLEX分子動力學分析。這使用戶能夠分析一個反應或折疊路徑等






New Features in CONFLEX v.6.0   

  • Crystal packing of conformers
  • Replace amino acid residues
  • Solvent Effect 
    CONFLEX can now calculate the energy using the Generalized Born solvent model (GB/SA).
  • Force Field options
    • Quasi-Interaction 
      Users can add the quasi-interaction effect to the force field. Users can also include additional restraints to specify the structural information.
    • Point Charge 
      Users can define the point charge on each atom.  For Gaussian users, one can apply the partial charge calculated by Gaussian, and estimate the electrostatic interactions.
  • Structure Optimization options
    • Switch between FAST and PRECISE Structure Optimization
    • Convergence and Iteration
      Users can specify the convergence criteria and iteration count for each optimization method.
  • Conformation Search Option 
    CONFLEX recognizes the R/S configurations of chiral atoms and E/Z of double bonds.  Users can now add your own absolute configuration of atoms.
  • Peptide Bond Option
    CONFLEX recognizes the rotatable bonds and add these to the stepwise    rotation list.   Users can exclude the peptide bonds(CO-NH), phi-psi bonds (CONH-Ca- CONH)   or side chain bonds from a stepwise rotation list.
  • Normal Mode Dynamics Analysis 
    By combining multiple vibrational mode, CONFLEX analyzes molecular    dynamics.  This enables users to analyze a reaction or folding path etc.