 CONFLEX可快速,準確,自動化的構象搜索和分析關鍵的藥物發現和化學工程。 是它獨有的CONFLEX搜索能力,完全靈活的空間構象分子找到每一個重大的最優結構的化學構象。CONFLEX不限於只在當地尋找優化結構,依賴於初始結構由用戶輸入。
--------------------------------------- 開發商:Conflex Corporation 原廠網址: http://www.conflex.us/products.asp更新日期:2011/05/11 採購正式版、大量授權報價、技術支援、軟體諮詢、委託採購、詢問報價請來電 02-29299388 分機16 , 來信service@orderble.com,或 點我------------------------------------------------------------------------------
新功能CONFLEX v.6.0 - 水晶包裝的構象
- 氨基酸殘基替換
- 溶劑效應
CONFLEX現在可以計算能源使用廣義出生溶劑型(國標 / SA)的。 - 力場選項
- 準互動
用戶可以添加準交互效果的力場。 用戶還可以包含其他的限制到指定的結構信息。 - 點電荷
用戶可以定義每個原子點電荷。高斯的用戶,可以申請的部分費用計算高斯,並估計靜電相互作用。
- 結構優化的選擇
- 之間切換快速精確的結構優化
- 收斂性和迭代
用戶可以指定的趨同標準,並為每個迭代計算優化方法。
- 構象搜索選項
CONFLEX承認的R / S配置的手性原子和E / Z的雙鍵。用戶現在可以添加你自己的絕對構型的原子。 - 肽鍵選項
CONFLEX認識到債券和可旋轉的逐步增加這些輪換名單。 用戶可以排除肽鍵(聯合新罕布什爾州),披- psi的債券(酰胺-鈣酰胺)或側鏈債券逐步從一輪換名單。 - 普通模式動力學分析
通過結合多種振動模式,CONFLEX分子動力學分析。這使用戶能夠分析一個反應或折疊路徑等
New Features in CONFLEX v.6.0 - Crystal packing of conformers
- Replace amino acid residues
- Solvent Effect
CONFLEX can now calculate the energy using the Generalized Born solvent model (GB/SA). - Force Field options
- Quasi-Interaction
Users can add the quasi-interaction effect to the force field. Users can also include additional restraints to specify the structural information. - Point Charge
Users can define the point charge on each atom. For Gaussian users, one can apply the partial charge calculated by Gaussian, and estimate the electrostatic interactions.
- Structure Optimization options
- Switch between FAST and PRECISE Structure Optimization
- Convergence and Iteration
Users can specify the convergence criteria and iteration count for each optimization method.
- Conformation Search Option
CONFLEX recognizes the R/S configurations of chiral atoms and E/Z of double bonds. Users can now add your own absolute configuration of atoms. - Peptide Bond Option
CONFLEX recognizes the rotatable bonds and add these to the stepwise rotation list. Users can exclude the peptide bonds(CO-NH), phi-psi bonds (CONH-Ca- CONH) or side chain bonds from a stepwise rotation list. - Normal Mode Dynamics Analysis
By combining multiple vibrational mode, CONFLEX analyzes molecular dynamics. This enables users to analyze a reaction or folding path etc.
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