新功能CONFLEX v.6.0   

• 水晶包裝的構象
• 氨基酸殘基替換
• 溶劑效應 
  CONFLEX現在可以計算能源使用廣義出生溶劑型（國標 / SA）的。
• 力場選項
  • 準互動 
    用戶可以添加準交互效果的力場。 用戶還可以包含其他的限制到指定的結構信息。
  • 點電荷 
    用戶可以定義每個原子點電荷。高斯的用戶，可以申請的部分費用計算高斯，並估計靜電相互作用。
• 結構優化的選擇
  • 之間切換快速精確的結構優化
  • 收斂性和迭代
    用戶可以指定的趨同標準，並為每個迭代計算優化方法。
• 構象搜索選項 
  CONFLEX承認的R / S配置的手性原子和E / Z的雙鍵。用戶現在可以添加你自己的絕對構型的原子。
• 肽鍵選項
  CONFLEX認識到債券和可旋轉的逐步增加這些輪換名單。 用戶可以排除肽鍵（聯合新罕布什爾州），披- psi的債券（酰胺-鈣酰胺）或側鏈債券逐步從一輪換名單。
• 普通模式動力學分析 
  通過結合多種振動模式，CONFLEX分子動力學分析。這使用戶能夠分析一個反應或折疊路徑等

New Features in CONFLEX v.6.0   

• Crystal packing of conformers
• Replace amino acid residues
• Solvent Effect 
  CONFLEX can now calculate the energy using the Generalized Born solvent model (GB/SA).
• Force Field options
  • Quasi-Interaction 
    Users can add the quasi-interaction effect to the force field. Users can also include additional restraints to specify the structural information.
  • Point Charge 
    Users can define the point charge on each atom.  For Gaussian users, one can apply the partial charge calculated by Gaussian, and estimate the electrostatic interactions.
• Structure Optimization options
  • Switch between FAST and PRECISE Structure Optimization
  • Convergence and Iteration
    Users can specify the convergence criteria and iteration count for each optimization method.
• Conformation Search Option 
  CONFLEX recognizes the R/S configurations of chiral atoms and E/Z of double bonds.  Users can now add your own absolute configuration of atoms.
• Peptide Bond Option
  CONFLEX recognizes the rotatable bonds and add these to the stepwise    rotation list.   Users can exclude the peptide bonds(CO-NH), phi-psi bonds (CONH-Ca- CONH)   or side chain bonds from a stepwise rotation list.
• Normal Mode Dynamics Analysis 
  By combining multiple vibrational mode, CONFLEX analyzes molecular    dynamics.  This enables users to analyze a reaction or folding path etc.